クリプトスポリジウム症()とはアピコンプレックス門のクリプトスポリジウム属に属する原生動物の寄生により哺乳類の腸に障害を与える寄生虫病。クリプトスポリジウム症は糞口経路によって伝播し、免疫系が健全なヒトに対しては自然寛解性の下痢が主要な症状である。しかしAIDS患者のように免疫不全状態の場合には、重症化ししばしば致死的になる。1976年まで確認されていなかったにもかかわらず、最も一般的な水系感染症の1つであり世界中で認められている。環境抵抗性のシスト（オーシスト）により伝播し、これを摂取すると小腸で脱嚢して腸管上皮組織への感染が成立する。