十二指腸（じゅうにしちょう、Duodenum）は、胃と小腸をつなぐ消化管である。全体の形はC字状で長さは約25cm。十二指腸の名は、長さが指12本を横に並べた長さ（指の幅×12）であることに由来する。実際には25～30cmくらいある。大部分が後腹膜に固定されており、可動性がない。

なお、小腸の一部とする考え方もあり、その場合は空腸と回腸と違い腸間膜に包まれないので無腸間膜小腸と呼称する場合もある。