胃から送られて来た食物をさらに消化し、空腸へ送る。

大十二指腸乳頭(ファーター乳頭)には胆管および主膵管が開口しており、肝臓から胆嚢を経由して胆汁を、膵臓から膵液を受ける。十二指腸から分泌されるエンテロキナーゼは、膵液中のトリプシノーゲンを活性化しトリプシンに転換する。

十二指腸では、脂肪、タンパク質、炭水化物が分解され、空腸に送られる。